陈佩琪提到，去年8月27日公公“柯爸”柯承发自台大新竹分院转院至台北总院进一步治疗，柯文哲担心病况，除要跑自己行程外，还常忙到三更半夜才去病房探视，8月30日原本已安排好要去病房签手术同意书的，结果家里被大搜索，搜索票只写“贪污治罪条例”，到底掌握到什么证据或搜索事由都没写，后来起诉书出来，通篇也没搜索前的证据，就都拿搜索出来的东西编故事构陷人入罪。
陈佩琪接着质疑，现在检察官说柯文哲8月27日至29日指使柯文哲前随行秘书“橘子”许芷瑜出境？“请问你们这样胡乱指控，证据在哪里？没证据可以胡乱栽赃污蔑吗？栽赃污蔑是检查官的权力？我说他忙到连睡觉时间都没有，还管到下属回来看牙齿？当然你们会不信太太讲的话，但双方手机都被你们查扣了，有否联络，有否传讯息或回收讯息，你们会不知道吗？讲先生指使出国，证据是什么？”
陈佩琪也提到，“说我们家藏6000万到3亿现金，就凭一个人的话就写到起诉书中？”既然在家里搜不到现金，想要写进起诉书中，却不思调阅周遭将近百支的监视器，看何时把钱运出去了？“我家没有车，也十年未用过车库，出入一定从前面大门，不调监视器，却硬要把别人栽赃的话写进起诉书里？先生在庭上说，他当医生，一生以救人为业，不知道竟有这种行业以害人为职志的？他没有要污辱你们这行的意思，他只是要表达请你们拿出专业来收集证据，以证据为准则，不是看到是柯文哲，事你们上头的政敌，就证据都不用，就全靠推断和臆测写起诉书。”
陈佩琪指出，“监察院”没入木可公司卖小物的数千万元，说是政治献金申报不实，检察官说这是柯文哲贪污侵占所得，求刑数十年， 请问法院和“监察院”，过去扁帽工厂、小英商号、赖桑小铺，设立后都没有金钱的收入吗？“他们也都是为选举而设立，难道这些公司没收到贩卖东西所得的钱吗？若没有，那成立这些公司是要干什么的？有收到钱入帐，成立这些公司的候选人为什么不是贪污侵占？”
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