陈美霞认为，对于传染病防治来讲，台湾公共卫生体系的市场化和医疗化主要有2个影响。
其一，传染病的防治工作成了冷板凳，不如医疗工作能带来政绩和利润，因此政府缺乏投入，医疗机构不重视。成功大学教授、台湾“中央研究院”研究员苏益仁发现台湾的医院最不重视的就是传染科。
其二，原本依靠卫生所的防疫体系长期缺乏投入，防治传染病、慢性病“个人责任化”。个人的健康问题被与社会剥离，导致基层政府对社区的健康状况实际上没有掌握，没有完成“通报、调查”和“预防”的工作。
总而言之，在经历了市场化与医疗化的演变之后，台湾当局失去了对卫生工作的把握，失去了对基层卫生状况的掌控。这是台湾执政者的问题，也是台湾卫生部门面对疫情时困难重重的根本原因。
在账面上，台湾的医院、诊所、卫生所遍布各县、市和乡、镇。在SARS疫情爆发的2003年，台湾有“医事人员”超过11万（包括医生、护士），医疗保健支出占台湾GDP的6.15%。然而这个体系在SARS的冲击下近乎“崩溃”，医疗机构疲于应战，以至于发生了和平医院封院的事件。
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